東トルキスタンは日本から西に約4000キロ離れた中央アジアに位置し、地理的にはカザフスタン、ロシア、モンゴル、キルギス、タジキスタン、アフガニスタン、パキスタン、インド、チベット、中国などの地域と接しています。
東トルキスタンは、ウラン、金などのレアメタルや石油など、鉱物資源が豊富な地域です。東トルキスタンの南部はタリム盆地があり、その中央には世界で二番目に大きいタクラマカン砂漠があります。タクラマカン砂漠の周囲は肥沃で農業に適した土地が広がっています。東トルキスタンは植物の種類が多様で、豊富な森林資源があります。